山门为明代所重建，为一并排三座拱门，代表三解脱门。部分门洞券面上刻有工匠姓名，皆为东汉遗物。五重大殿由南向北依次为天王殿、大佛殿、大雄殿、接引殿和毗卢殿。主殿是第二重殿大佛殿，也是做法事的主要场所，第三重殿叫大雄殿，里面摆放的是元代“夹贮干漆造像”工艺做的塑像，包括三世佛，左右二天将，及殿东西两侧的十八罗汉像，是中国仅存的一套元代“夹贮干漆造像’，为白马寺的镇寺之宝。 白马寺中还保存着自唐以来的历代碑碣40余座，以元代书法家赵孟頫手书的《洛京白马寺祖庭记》最为珍贵。

山门外东南约200米处，有一座齐云塔，共十三层，高约24米。该塔风格独特，具有较高的艺术价值，是中原地区为数不多的金代古建筑之一。现今在寺旁又新建了一个世界佛殿博览区，以展示印度、泰国、斯里兰卡、尼泊尔、缅甸、日本、韩国等国家风格的佛教殿堂。